找回密码
 立即注册
搜索
查看: 790|回复: 6

gromacs如何计算不同层的界面张力

[复制链接]

1

主题

3

回帖

17

积分

新手上路

积分
17
发表于 2024-6-19 18:31:58 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 老王隔壁 于 2024-6-20 11:11 编辑

我的体系是 水层(中间层)  脂质层(上下绿色部分)  我在最上层加入了我的表面活性剂,接下来我想计算(1)嵌入表面活性剂的油水界面的表面张力(2)下层没有活性剂的油水界面的表面张力            我想计算这两处的界面张力,请问如何实现呢?

本帖子中包含更多资源

您需要 登录 才可以下载或查看,没有账号?立即注册

×

0

主题

12

回帖

223

积分

管理员

积分
223
发表于 2024-6-19 21:31:02 | 显示全部楼层
首先,说下你的问题跟第一性原理没有关系,然后你没有必要重复上传图片
然后你的问题最好能说清楚,你告诉我你的界面哪里来的 油 水 空气交接处,根本没有

1

主题

3

回帖

17

积分

新手上路

积分
17
 楼主| 发表于 2024-6-20 11:11:49 | 显示全部楼层
admin 发表于 2024-6-19 21:31
首先,说下你的问题跟第一性原理没有关系,然后你没有必要重复上传图片
然后你的问题最好能说清楚,你告诉 ...

已修改

0

主题

12

回帖

223

积分

管理员

积分
223
发表于 2024-6-21 18:33:43 | 显示全部楼层

gromacs计算表面张力的公式



n代表体系的界面数,比如一层水上下都是空气的体系n=2
Lz是盒子Z方向的长度,单位nm
{}代表取时间平均
Pzz每帧的zz方向压力
Pxx每帧的xx方向压力
Pyy每帧的yy方向压力

如果是真空体系则需要跑NVT处理
两液相计算表面张力控压,半各项异性控压,z方向压缩率不为0,xy方向为0

本帖子中包含更多资源

您需要 登录 才可以下载或查看,没有账号?立即注册

×

1

主题

3

回帖

17

积分

新手上路

积分
17
 楼主| 发表于 2024-6-21 19:18:25 | 显示全部楼层
admin 发表于 2024-6-21 18:33
gromacs计算表面张力的公式

邱老师您好,感谢您的回复。这个公式之前看过的,但是我想请教您,这个公式的Lz是盒子Z方向的长度,但是我的这个盒子Lz已经确定了,所以这个公式计算完了是依旧是总的界面张力呀。[img][/img]

1

主题

3

回帖

17

积分

新手上路

积分
17
 楼主| 发表于 2024-6-21 19:20:56 | 显示全部楼层
老王隔壁 发表于 2024-6-21 19:18
邱老师您好,感谢您的回复。这个公式之前看过的,但是我想请教您,这个公式的Lz是盒子Z方向的长度,但是 ...

请问能不能用高度差来计算

本帖子中包含更多资源

您需要 登录 才可以下载或查看,没有账号?立即注册

×

0

主题

12

回帖

223

积分

管理员

积分
223
发表于 2024-6-24 10:47:23 | 显示全部楼层
老王隔壁 发表于 2024-6-21 19:20
请问能不能用高度差来计算

分开单独建模来做,不要一个体系分析几个体系的内容
您需要登录后才可以回帖 登录 | 立即注册

本版积分规则

Archiver|手机版|小黑屋|凯算计算

GMT+8, 2025-4-2 23:16 , Processed in 0.059498 second(s), 23 queries .

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2024 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表