Ensemble: 选择用于动力学计算的热力学系综 Initial velocities:选择要用于动力学计算的速度初始化方法 Temperature:指定模拟的目标温度，单位为K。默认值=298.0 K。 Pressure:指定在模拟过程中要应用于周期单元的外部压力，单位为GPa。默认值为0.0 GPa。 Time step: 指定每个动力学步长的时间（以fs为单位）。这也决定了模拟总时间。默认值为1.0 fs。 Total simulation time: 指定动力学模拟将运行的总时间（以ps为单位）。这也决定了步骤数。默认值=5 ps。 Number of steps: 指定动力学步数。这也决定了模拟总时间。默认值=5000。 Frame output every: 指定将帧写入轨迹文件的频率。默认值=5000。 如果选择了“Solvation Free Energy”任务，则“Frame output every”的默认值为10。 如果选择了淬火或退火任务，则“动力学”选项卡上的各种控件将被禁用，如下所示： 如果正在运行淬火动力学计算，将禁用每个控件的“帧输出”。 如果正在运行退火动力学计算，“温度”、“总模拟时间”、“步数”和“帧输出频率”控件将被禁用。 Fix bonds: 选中时，Forcite将自动检测和修复结构中的键。如果键的（近似）振荡周期小于时间步长的10倍，则键将是固定的。期限超过10个时间步长的键是灵活的。 默认的时间步长1 fs通常不会产生固定的键，因为大多数振动周期都超过10 fs。 如果将“时间步长”增加到2 fs，则与氢等轻原子相连的键将被固定。 Calculate：将距离测量值添加到将标记为固定以进行计算的绑定中。
对于周期性系统，可用选项包括： NVE：恒数量恒体积恒能量 NVT：恒数量恒温恒体积 NPH：恒数量恒压恒焓 NPT：恒数量恒温恒压 对于非周期性系统，只有NVE和NVT系综可用。默认值=NVE。 如果选择了“溶解自由能量”任务，则3D周期系统的默认值为NVT。
Random将初始速度设置为温度相关高斯分布的随机值，默认 Current将初始速度设置为当前在结构上定义的值。
Thermostat：选择用于控制NVT或NPT模拟温度的算法 Nose Andersen Berendsen NHL Temp. difference：指定速度刻度恒温器的实际温度和目标温度之间的温差，单位为K。默认值=10.0 K。 仅当选择了“Velocity Scale”算法时，才能指定温度差。 Q ratio: 指定用于缩放Nosé和NHL恒温器的虚拟质量Q的值。有效弛豫时间与Q比的平方根成正比。值为1将产生1 ps的有效松弛时间。默认值=0.01。只有在选择了Nose或NHL算法时，才能指定Q比率。 Collision ratio: 指定碰撞周期应乘以的因子。默认值为1.0。只有在选择了Andersen算法的情况下才能指定碰撞比率。 Decay constant: 指定Berendsen或NHL恒温器使用的衰变常数的值，单位为ps。默认值为0.1 ps（贝伦森），1.0 ps（NHL）。只有选择了Berendsen或NHL算法，才能指定Decay常数。
Barostat：选择用于控制NPH或NPT模拟压力的算法 Andersen Berendsen (default) Parrinello Souza-Martin：“任务”设置为“剪切”时，“Souza Martins”选项不可用。 Cell time constant: 指定Andersen、Parrinello或Souza Martins气压计使用的单元时间常数的值，单位为ps。Andersen和Parrinello默认为1.0 ps，Souza Martins默认为10.0 ps。只有选择了Andersen、Parrinello或Souza-Martins算法，才能指定Cell时间常数。 Decay constant: 指定Berendsen气压计衰变到目标压力的半衰期，单位为ps。默认值=0.1 ps。只有选择了Berendsen算法，才能指定Decay常数。 External stress: 指定外部应力张量的分量，单位为GPa。默认值为0 GPa。 Equivalent hydrostatic pressure: 该压力等于应力张量对角线分量平均值的负值。 Reset:将应力张量的分量设置为零。 只有选择了Souza Martins算法，才能指定外部应力。
Energy deviation：指定生产模拟的连续步骤之间允许的最大能量差。默认值=50000.0 kcal/mol。 Include velocities: 选中时，表示原子速度数据将写入轨迹文件的每一帧。 Include forces：选中时，表示原子力数据将写入轨迹文件的每一帧。 Use multiple time steps：选中时，表示动力学将使用多时间步长算法。 K-space time step: 这是用于静电相互作用的倒数空间部分的时间步长（仅当启用多个时间步长时）。根据“动力学”选项卡上的“时间步长”设置，将报告相应的标准时间步长数。默认值=4 fs。 |
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