Quench只是动力学计算产生的每个结构也被最小化。因此,淬火动力学运行将创建两个轨迹文件。标准轨迹文件与标准动力学运行产生的文件相同,并且淬火轨迹包含与输出到标准轨迹的每个帧相对应的最小化结构。 Quench every:指定将帧写入轨迹文件的频率。默认值=5000。 Dynamics options:允许为淬火计算的动力学部分设置参数。这包括选择动力学系综并指定模拟的时间步长和总时间。 Geometry optimization options:允许为淬火计算的几何最小化部分设置参数。 |
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