Solvation Free Energy

Contribution: 指定要计算的自由能量贡献。指定“全部”将在一次计算中计算所有贡献。

Algorithm: 指定用于计算溶剂化自由能的算法。

Equilibration steps:平衡步数，默认值=5000

Production steps: 采样步数，默认值=10000

Dynamics options:，该对话框允许您指定在计算的平衡和生产阶段使用的动力学选项。

Geometry optimization options:该对话框允许您指定平衡运行之前的几何优化阶段的详细信息。

Coupling parameter:指定耦合参数的间隔以及该间隔中的步数。相反的过程可以通过指定从1到0的耦合参数来实现。

Start: 默认值为0.0。

End: 默认值为1.0。

Steps: 默认值=20。

对于反向过程，所报告的自由能的符号被反转，从而与正向过程的符号相匹配。

Solute atoms:将选定的原子添加到SoluteAtoms集合：使用活动的3D原子文档中当前选定的原子创建一组名为SoluteAtomics的原子。如果已经为活动文档定义了名为SoluteAtoms的集合，则任何尚未成为该集合成员的选定原子都将添加到该集合中。