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Forcite Preparation

2024-6-19 14:04| 发布者: admin| 查看: 246| 评论: 0|来自: MS手册

摘要: Calculate automatically:选中时,表示力场类型将在模拟开始时自动计算。有时,自动计算的力场类型不合适。可以使用“Assign”按钮或“Properties Explorer”手动应用力场类型。然而,在正常情况下,不需要手动分配 ...

Calculate automatically:选中时,表示力场类型将在模拟开始时自动计算。

有时,自动计算的力场类型不合适。可以使用“Assign”按钮或“Properties Explorer”手动应用力场类型。然而,在正常情况下,不需要手动分配,对于大型系统来说,这可能是一项耗时的任务。

当自动分配失败时,有必要手动分配力场类型。在这种情况下,应首先取消选中“Calculate automatically”复选框,然后选择适当的力场类型,最后单击“Assign”按钮将力场类型应用于系统,以防止自动键入。

当您使用COMPASSII、pcff或cvff力场时,应分配正确的正式电荷,以便分配正确的力场类型。

这对于自动分配可能不合适的金属、金属卤化物和金属氧化物原子尤其重要。如果不确定,请查看当前模块的“Preparation Options”对话框上的“Description of the Forcefield type”。

对于离子结构,例如金属氧化物,金属和氧原子之间的键主要是离子的。这意味着共价键的概念不适用于这些结构,必须删除该键才能进行计算。相反,原子必须结合,这样力场类型引擎才能检测原子的环境,从而正确预测成键。

在这种情况下,应使用键入引擎为原子指定力场类型和电荷,然后在执行任何计算之前移除键。否则,计算将查找不存在的键参数,并且计算将失败。


Bond order:键序
Calculate automatically: 选中时,表示将在模拟开始时自动计算适用于通用力场的键序。这些键序用于构造在能量表达式中使用的力场参数。默认值=选中。与力场类型一样,可以手动指定键序,但不建议这样做。
只有在“Universal力场”用于模拟的情况下,即“Forcefield type”对话框的“Energy”选项卡上的“Forcefield type”已设置为“Universal力场”时,才能计算键序。
Calculate:计算所选分子片段的键序。这对于已经制备并随后扩展的系统是有用的,例如已经添加了一个或多个分子。只要没有与原始系统建立连接,就可以选择新的子结构,然后在不影响原始结构的情况下计算键序。

Charges: 从下拉列表中选择一种计算用于评估静电相互作用的原子电荷的方法。
对于Dreiding和Universal力场,可用选项包括:
Use current (default)
Charge using QEq
Charge using Gasteiger
如果选择COMPASSII、cvff或pcff力场,则默认为“Forcefield assigned”,因为电荷分配是存储在这些力场定义中的参数的一部分。
Calculate: 使用指定的电荷方法确定当前选择中原子的原子电荷。

Charge groups:电荷组
Calculate automatically: 选中时,表示将在模拟开始时自动计算电荷组。默认值=选中。
只有当结构尚未包含有效的电荷组时,才会自动计算电荷组。
静电和/或范德华相互作用必须使用基于组的求和方法(即,静电或范德华已根据“强制计算”对话框的“能量”选项卡设置为“组”),以便自动计算电荷组。
More:该对话框允许您计算、定义和删除充电组。

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