特定的子类型(这里通常称为“标签”)是微调Martini 3CG模型的简单方法。这个概念在之前的版本中已经存在,但只应用于N型和Q型,以考虑具有相似疏水程度的分子中不同的氢键能力。在Martini3中,标签被扩展,可以应用于所有珠子,轻微改变它们的行为,这转化为相互作用矩阵的微小变化。其中三个标签(氢键、电子极化、正/负)是化学特异性的,这意味着它们只适用于特定的化学类型。另外两种标签(自相互作用,部分电荷)更为通用,可以应用于有机块的所有珠上,包括已经用一些化学特定标签修饰过的珠上。 |
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