为了更精确和准确地定义珠子类型，需要考虑与不同片段的接近程度，特别是对于较小的珠子类型(即更高的分辨率)。通常情况下，在一个特定的珠子分配(在补充表24中定义)的默认解周围，小的扰动是允许的，这取决于与其他珠子的接近/连接。考虑邻近性的选择类型应考虑的主要方面是： 由相邻化学基团引起的感应和/或共轭效应。在这些情况下，可以使用化学类型的变化和/或标签“v/e”应用于相邻的珠子。Aedamers是甲氧基和羰基如何影响芳香碳头配位的好例子。带电碎片的效果甚至更强。 局部偶极子的变化，由于化学基团之间的接近，影响默认头的极性选择。核碱基就是这种情况的明显例子。另一个潜在的变化是自交互作用，这可以通过“h/r”标签进行微调。 内部氢键，它可以改变分子中质子和电子对的可用性。这些影响可以改变氢供体/受体的能力(因此最好选择无标签或“d/a”标签)，也可以改变油/水转移的自由能。 模型的分辨率，这是通过选择映射和头部大小来定义的。线性烷烃就是一个很好的例子。低分辨率模型是基于常规尺寸的C1微珠，而高分辨率模型可以区分碳链中间(C1型)或末端(C2型)的微珠类型。这些差异也存在于原子模型中，对于与不同数量的氢原子结合的碳原子有不同的LJ参数。直链烷烃和支链烷烃在头型上的不同，也反映了末端和中间碳原子数量的不同。 在复杂的情况下，同一分子中可能存在多个接近效应，这使得最佳的头选择变得非常重要。在这种情况下，我们建议用户从目前的Martini 3的CG模型(可在http：//cgmartini.nl/)中获得灵感。进一步扩展Martini 3小分子数据库可能有助于更好地完善这些想法，改进最佳化学头类型和标签的分配。 考虑到q-珠子所代表的带电基团的多样性，以及离子可能具有的所有不同大小的次优表示，需要更精确的头分配。补充表25显示了目前离子的最佳选择，包括化学类型、大小和净电荷。
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