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原子电荷

2024-6-10 10:08| 发布者: admin| 查看: 45| 评论: 0|来自: 邱新龙版《分子动力学模拟基本概念》

摘要: 高中的时候学化学就不要放到做计算里来了原先认为CH4总电荷为0,所以每个原子电荷为0实际上由于原子的不同,对于电子束缚能力的不同所以共价键上的电子对会发生偏移导致原子带电荷不再是0所有原子带的电荷不再是原先 ...
 

高中的时候学化学就不要放到做计算里来了

原先认为CH4总电荷为0,所以每个原子电荷为0

实际上由于原子的不同,对于电子束缚能力的不同

所以共价键上的电子对会发生偏移

导致原子带电荷不再是0


所有原子带的电荷不再是原先的0

只是原先的电荷总是0

所以需要计算好静电相互作用

关于原子电荷分布这个必须了解


由于原子电荷的计算没有定性的说法和计算方法,找到合适的就行

所以参考学习doi: 10.3866/PKU.WHXB2012281 该文献


原子电荷计算方法

Mulliken——最早的原子电荷计算方法,基于波函数进行处理

NPA——这个就是NBO电荷,大部分软件可以计算

RESP——AMBER,GAFF,GLYCAM使用,RESP2(0.5)效果更好

CM5——1.2*CM5用于OPLS-AA

MMFF94——MMFF力场

AM1-BCC——近似于RESP的方法

ADCH——对于基组依赖比较低的一种方法

QEq——UFF,Dreiding力场


在某些软件上如果只有Gasteiger方法和QEq,建议使用QEq

其他如果没有力场特别匹配的原子电荷方法

可以考虑使用RESP和AM1-BCC方法,ADCH方法

图片来源:https://zhimap.com/mmap/5f4f3399043141da8e3c6affe94be26a


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