怎么理解分子动力学模拟MD?

什么是分子动力学模拟，从文字上看就是看分子的动力学过程模拟，所谓的动力学在这里可以理解为牛顿运动定律，不知道的翻下中学课本，根据牛顿运动定律，我们是知道的F=ma，a=(v2-v1)/t。

根据上面的公式，我们知道F就是力，分子动力学研究的是原子尺度，原子之间的受力就会跟运动方程有关，所以我们需要知道原子受什么类型的力，比如分子内的原子，分子间的原子，这些类型是共价键，离子键（这个里面又要看共价性与离子性的问题），金属键，氢键等等键的类型。

m是质量，这个质量看元素周期表就可以知道

a是加速度，由于F是矢量，所以a也是矢量，就是有方向的

t是时间，你自己设定的

剩下的速度v，还有移动距离就可以交给服务器或者电脑进行计算了

我们后续要分析的就是F的变化，v的变化，距离l的变化，体系稳定后的结构特征等等