在MD模拟计算中,我们主要是研究系统的热力学性质与动力学性质 而热力学和统计力学的研究对象,都是由大量原子、分子等微观粒子组成 并与其周围环境相互作用着的宏观体系,即热力学体系。 只有少数几个微观粒子组成的体系没有代表性,不能称为热力学体系。 在 MD模拟中,首先必须保证所模拟体系包含足够多的微观粒子,具有代表性, 否则模拟结果无法代表模拟体系的宏观性质、模拟无效 其次,热力学体系必须有限,热力学不研究由无限的原子、分子等微观粒子组成的无限体系 所以也是建议大家必须选择合适的粒子数目进行MD模拟 只有热力学平衡状态才可以用一组确定的参数描述,热力学非平衡状态则不能 热力学平衡状态是指那些在没有外界影响的条件下不随时间而变化的状态 显然,处于热力学平衡状态的体系,其内部必然存在着热平衡、力平衡 当有化学反应时还同时存在着化学平衡 所以计算热力学性质时,需要分析平衡后的状态 |
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