由于宏观与微观之间的转换存在着系综分析,而系综是所有情况的集合 那么如何描述好体系,更好的表达结构,处理好系综的描述是MD非常重要的 模型体系的盒子大小应该尽可能装下各种微观特征尺寸,主要结合你的分析: 1.小分子的均相体系,只要差不多就好 2.非常稀的溶液,你要保障每个物质都有足够的分子数,别最少的就1个,那还统计啥 3.模拟高分子体系时,有时选择实验测出来的聚合度,,如果太大导致你无法计算可以适当调小,考虑自身机时和费用,够分析内容就好 4.对于一些非均相体系,你要保障有足够的体积,用来保障相中的分子数 5.模拟平衡时间必须长,同时统计的要足够多些,便于统计分析 6.模拟平衡变化的,也必须要时间长,不要相还在变化或者原来的相都还没开始变化,就开始统计了 |
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