范德华作用计算-最近邻像约定

2024-6-11 09:49| 发布者: admin| 查看: 122| 评论: 0|来自: 邱新龙版《分子动力学模拟基本概念》

摘要: 分子动力学模拟中计算最耗时的就是非键相互作用，假设你就N个原子那么每个2之间就需要计算一次相互作用力，那么就是CN2=N*(N-1)/2如果你是计算多体势，那么需要计算的数量会更多，所以我们需要考虑处理最近邻像约定 ...

分子动力学模拟中计算最耗时的就是非键相互作用，假设你就N个原子

那么每个2之间就需要计算一次相互作用力，那么就是CN2=N*(N-1)/2

如果你是计算多体势，那么需要计算的数量会更多，所以我们需要考虑处理

最近邻像约定，尤其是针对于PBC体系

这个是不是最近邻像约定

只是个人突然想到盒子不能太小

同时也用这个图告诉大家如果是

长程作用，如库仑作用

就不能用此方法进行去做约束

原则上A会受到C的影响，但是C只是镜像

对应的是B，如果用B作为计算那么距离会边长

如果周期的C都计算，那么也是错的

这个时候我们只计算最近这个周期的位置

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