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约束—LINCS算法

2024-6-11 13:26| 发布者: admin| 查看: 294| 评论: 0|来自: 邱新龙版《分子动力学模拟基本概念》

摘要: 对含有键角约束的分子可能会出现问题使用额外的距离约束来约束键角会引入多个小的环状结构这样分子的连通度变高,导致特征值变大因此LINCS 方法不能用于耦合键角约束对MD计算四阶展开就足够了;对Brown动力学, 使用大 ...

对含有键角约束的分子可能会出现问题

使用额外的距离约束来约束键角

会引入多个小的环状结构

这样分子的连通度变高,导致特征值变大

因此LINCS 方法不能用于耦合键角约束

对MD计算四阶展开就足够了;

对Brown动力学, 使用大的时间步长时,

可能需要八阶展开


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